TVシリーズ『アクエリオン』とは、設定のほとんどを引き継ぎながらも作品の放つメッセージが、DVDシリーズは少し異なっている。ずばりここで問われているのは、「人と人の間にあるもの」だ。この問いの答えは本作品内にあるのでここでは書かないが、アクエリオンの特徴としてアニメーション特有のフィクション性が本作品の神話世界によって強調される。その逆にこのメッセージの呼びかけはいやに現実味を帯びることとなる。

このフィクショナルな世界からのリアルな問いから何かを感じ取れたなら、TVシリーズも激しくお勧めする（DVDから観始める人は稀有だと思うけども）。また、『アクエリオン』とは「フィクション」と「問い」の距離感は違うが、同じ河森作品で『アルジュナ』なども比較してみると面白いかもしれない。